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Compte tenu des infos limitées que tu donnes, je suppose que le problème se pose en important des photos via darktable sur Ubuntu.
Ubuntu monte automatiquement le support externe (carte mémoire, appareil photo) avec son gestionnaire de fichiers quand ce support est détecté, ce qui empêche Gphoto2 de le réserver pour que darktable puisse l'utiliser.
Il suffit d'éjecter/démonter le support concerné dans ton navigateur de fichiers (Nautilus ou autre) puis de redémarrer darktable. Il faut aller jouer dans les options du système d'exploitation pour dire à Ubuntu de ne rien faire quand un media externe est branché.
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et aussi voir si le probleme ne vient pas du fait qu'il y a gvfs-gphoto2 chargé et qui "prenne" le port usb . j'ai eu le probleme lorsque je lancais un script à moi qui bloquait sur le chargement des photos que j'ai résolu en faisant killall gvfsd-gphoto2
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